जमीन ज्यादा पारगम्य न हो तो जमीन के गड्ढों में पानी जमा हो जाता है।
फलदार वृक्षों के लिए रुका हुआ पानी हमेशा प्रतिकूल होता है। हालांकि, यदि पौधों की सुप्त अवधि के दौरान बाढ़ आती है, तो यह आमतौर पर पेड़ की मृत्यु का कारण नहीं बनता है। पेड़ की जड़ें निष्क्रिय होती हैं और पानी नहीं लेती हैं।वसंत के जितने करीब होते हैं, जड़ों में बाढ़ आना उतना ही खतरनाक होता है। फलों के पेड़ों की जड़ें बढ़ने लगती हैं जब मिट्टी का तापमान शून्य से कुछ डिग्री ऊपर पहुंच जाता है।
बढ़ते बालों की जड़ें ऑक्सीजन के अभाव में मर जाती हैं, यानी पानी नहीं खींच पाता और पौधा मरने लगता है। कभी-कभी जड़ों में कुछ दिनों की बाढ़ भी पौधों को बीमार करने के लिए पर्याप्त होती है। हम उन्हें इससे कैसे बचा सकते हैं? रोपण के लिए ऐसी जगह चुनें जहां पानी जमा न हो।
ढलान या थोड़ा ऊंचा क्षेत्र सबसे अधिक फायदेमंद होता है।छोटे बगीचों में जहां ज्यादा जगह नहीं होती है, अगर पोखर दिखाई देते हैं, तो पानी निकालने के लिए एक जल निकासी नाली खोदनी चाहिए।कुंड जितना गहरा होता है, उतनी ही तेजी से अतिरिक्त पानी निकल जाता है।